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医学实验/引物设计经验总结

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医学实验/引物设计经验总结

本帖最后由 一只虫子 于 2016-7-27 09:36 编辑

  深圳中洪博元生物技术有限公司   因为专注,所以专业。
引物序列的特异性是决定PCR特异性扩增的主要因素。现在我们常用引物设计软件来进行引物设计,但如注意到以下条件将会事半而功倍:

1)  引物长度在15~30 bp为佳,过长的引物与模板复性杂交速率减慢,降低扩增效率,过短则会降低特异性。

2)  引物内部不应形成二级结构,两引物之间不能互补。

3)  碱基应随机分布,(G+C)%最佳含量在45%~55%,应避免4个以上的相同碱基排列。

4)  引物3’端和模板的碱基最好完全配对,而引物3’端最后5~6个核苷酸与模板的错配应尽可能少。

5)  引物3’端碱基最好是T、G、C而不是A,这样会有利于延伸。

6)  可在引物5’端添加不与模板互补的额外序列以便于后续分析。


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